この記事は何？ 分子構造可視化ソフトウェアの1つにChimeraというものがあります． 例えばタンパク質の立体構造を読み込むと下のような図を描画してくれます(PDBID: 1LCI)． この図からいくつかコマンドを叩くと下のような綺麗な図も描くことが出来ます． 上…

ヌメロンというゲームをご存知でしょうか． 簡単に言うと二人で遊ぶ数字当てゲームです． お互いに数字をコールしていき，数字と桁が一致している数･数字は合っているが桁は異なる数を教えます． 結構頭を使うゲームで，慣れていないとなかなか推理できませ…

この記事は何？ Pythonでsetからランダムサンプリングするコードを書いたところ，非常に時間がかかっていたので簡単に計測した時のメモです． 実行環境はPython 3.5.1 (Anaconda 2.5.0)です． 実験条件 サンプリング元はlistおよびsetとし，サイズを10, 100,…

この記事は何？ 機械学習分野における予測精度の評価指標としてROC-AUCがよく用いられています． ROC-AUCは分類問題で用いられる評価指標ですが，ROC-AUCを直接最適化できるとお得です． 機械学習の一つにランキングを学習するランク学習という枠組みがあり…

この記事は何? 生態学データ解析 - 本/データ解析のための統計モデリング入門の第9章ではGLMを題材としたMCMCが紹介されています． この本ではMCMCのソフトウェアとしてWinBUGSが使われていますが，インストールバトルに負けたのでPyStanを使って第9章の例題…